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Enregistrement W2064377262 · doi:10.3109/00498254.2012.751141

A simplified approach to predict CYP3A-mediated drug–drug interactions at early drug discovery: validation with clinical data

2012· article· en· W2064377262 sur OpenAlexaff
Nathalie Rioux, Joëlle Batonga, Federico Colombo, Jonathan Massé, Christine Zouki, Maria Ribadeneira, Jianmin Duan, Richard C. Bethell

Notice bibliographique

RevueXenobiotica · 2012
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensBoehringer Ingelheim (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrugDrug discoveryDrug-drug interactionPharmacologyDrug metabolismComputational biologyMedicineBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1. The present study evaluates which factors should be incorporated into a simplified approach to reasonably predict CYP3A-mediated drug-drug interaction (DDI) at an early drug discovery stage. 2. CYP3A IC50 values were obtained using human liver microsomes (HLM) and hepatocytes. Plasma and microsomal protein binding and in vitro hepatocyte partition coefficient (Kp) were also determined for 10 drugs. Therapeutic human maximum plasma concentrations (Cmax) were retrieved from the literature. DDI predictions were performed using an equation incorporating the fraction of the substrate metabolized by CYP3A with the total or free plasma Cmax, with or without correction for hepatocyte Kp. 3. Based on the Ki data from HLM, the use of total Cmax provided a prediction of DDI within 2-fold of the observed clinical values for 9 out of 10 drugs. 4. In comparison, free drug corrections for both Cmax and Ki values from HLM led to an underprediction of DDI (>3-fold error for five drugs). 5. Data from hepatocytes showed, in general, lower prediction accuracy than data from HLM. 6. CYP3A-mediated DDIs can be predicted with a high level of accuracy based on Ki estimates from HLM data and the total therapeutic plasma Cmax of the inhibitors. This approach should be widely applicable to the assessment of clinically significant DDIs risk in early drug discovery programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,397
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,197
Tête enseignante GPT0,461
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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