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Enregistrement W2064392740 · doi:10.1073/pnas.1012931107

The <i>Vibrio cholerae</i> type VI secretion system displays antimicrobial properties

2010· article· en· W2064392740 sur OpenAlexafffund
Dana L. MacIntyre, Sarah T. Miyata, Maya Kitaoka, Stefan Pukatzki

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesFondation pour la Recherche MédicaleUniversity of Alberta
Mots-clésVibrio choleraeMicrobiologyType VI secretion systemVirulenceBiologyEscherichia coliCholeraEl TorBacteriaCholera toxinVibrionaceaeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The acute diarrheal disease cholera is caused by the marine bacterium Vibrio cholerae. A type VI secretion system (T6SS), which is structurally similar to the bacteriophage cell-puncturing device, has been recently identified in V. cholerae and is used by this organism to confer virulence toward phagocytic eukaryotes, such as J774 murine macrophages and Dictyostelium discoideum. We tested the interbacterial virulence of V. cholerae strain V52, an O37 serogroup with a constitutively active T6SS. V52 was found to be highly virulent toward multiple Gram-negative bacteria, including Escherichia coli and Salmonella Typhimurium, and caused up to a 100,000-fold reduction in E. coli survival. Because the T6SS-deficient mutants V52ΔvasK and V52ΔvasH showed toxicity defects that could be complemented, virulence displayed by V. cholerae depends on a functional T6SS. V. cholerae V52 and strains of the O1 serogroup were resistant to V52, suggesting that V. cholerae has acquired immunity independently of its serogroup. We hypothesize that the T6SS, in addition to targeting eukaryotic host cells, confers toxicity toward other bacteria, providing a means of interspecies competition to enhance environmental survival. Thus, the V. cholerae T6SS may enhance the survival of V. cholerae in its aquatic ecosystem during the transmission of cholera and between epidemics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations423
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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