Characterization of a Novel Alanine-rich Protein Located in Surface Microdomains in Trypanosoma brucei
Notice bibliographique
Résumé
Heterologous expression in COS cells followed by orientation-specific polymerase chain reaction to select and amplify cDNAs encoding surface proteins in Trypanosoma brucei resulted in the isolation of a cDNA ( approximately 1.4 kilobase) which encodes an acidic, alanine-rich polypeptide that is expressed only in bloodstream forms of the parasite and has been termed bloodstream stage alanine-rich protein (BARP). Analysis of the amino acid sequence predicted the presence of a typical NH(2)-terminal leader sequence as well as a COOH-terminal hydrophobic extension with the potential to be replaced by a glycosylphosphatidylinositol anchor. A search of existing protein sequences revealed partial homology between BARP and the major surface antigen of procyclic forms of Trypanosoma congolense. BARP migrated as a complex, heterogeneous series of bands on Western blots with an apparent molecular mass ( approximately 50-70 kDa) significantly higher than predicted from the amino acid sequence ( approximately 26 kDa). Confocal microscopy demonstrated that BARP was present in small discrete spots that were distributed over the entire cellular surface. Detergent extraction experiments revealed that BARP was recovered in the detergent-insoluble, glycolipid-enriched fraction. These data suggested that BARP may be sequestered in lipid rafts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».