Identification of Mechanisms Underlying Transporter Associated with Antigen Processing Deficiency in Metastatic Murine Carcinomas
Notice bibliographique
Résumé
Expression of transporter associated with antigen processing (TAP) is often lost in metastatic carcinomas, resulting in defective antigen processing and presentation and escape of the cancer cells from immune surveillance. In this study, the nature of TAP deficiencies in tumors was investigated. By chromatin immunoprecipitation assay, we showed that the recruitment of RNA polymerase II to the TAP-1 gene was impaired in TAP-deficient cells derived from murine melanoma, prostate, and lung carcinomas, compared with TAP-expressing fibroblasts and lymphoma cells. This suggested that the deficiency in TAP-1 expression resulted, at least partially, from a relatively low level of transcription of the TAP-1 gene. Furthermore, levels of TAP-1 promoter activity, as assessed by stable transfections with a reporter construct containing the TAP-1 promoter, were relatively low in TAP-deficient cells. To examine genetic heritability of regulators of TAP-1 promoter activity, TAP- and MHC class I-deficient cells of H-2b origin were fused with wild-type fibroblasts of H-2k origin. Fusion with TAP-expressing cells complemented the low levels of TAP-1 promoter activity in TAP-deficient cells. However, these fused cells exhibited lower levels of TAP-1 mRNA and H-2k than unfused fibroblasts. Further analysis showed that TAP-1 mRNA stability was lower in fused carcinoma fibroblasts than in unfused fibroblasts. Based on these results, we propose that TAP deficiency in many carcinomas is caused by a decrease in activity/expression of trans-acting factors regulating TAP-1 promoter activity, as well as a decrease in TAP-1 mRNA stability. These results have significant implications for understanding immune evasion mechanisms in tumors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».