ProQ Is an RNA Chaperone that Controls ProP Levels in <i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
Transporter ProP mediates osmolyte accumulation in Escherichia coli cells exposed to high osmolality media. The cytoplasmic ProQ protein amplifies ProP activity by an unknown mechanism. The N- and C-terminal domains of ProQ are predicted to be structurally similar to known RNA chaperone proteins FinO and Hfq from E. coli. Here we demonstrate that ProQ is an RNA chaperone, binding RNA and facilitating both RNA strand exchange and RNA duplexing. Experiments performed with the isolated ProQ domains showed that the FinO-like domain serves as a high-affinity RNA-binding domain, whereas the Hfq-like domain is largely responsible for RNA strand exchange and duplexing. These data suggest that ProQ may regulate ProP production. Transcription of proP proceeds from RpoD- and RpoS-dependent promoters. Lesions at proQ affected ProP levels in an osmolality- and growth phase-dependent manner, decreasing ProP levels when proP was expressed from its own chromosomal promoters or from a heterologous plasmid-based promoter. Small RNA molecules are known to regulate cellular levels of sigma factor RpoS. ProQ did not act by changing RpoS levels since proQ lesions did not influence RpoS-dependent stationary phase thermotolerance and they affected ProP production and activity similarly in bacteria without and with an rpoS defect. Taken together, these results suggest that ProQ does not regulate proP transcription. It may act as an RNA-binding protein to regulate proP translation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».