MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2064514167 · doi:10.1002/humu.21085

RFT1 deficiency in three novel CDG patients

2009· article· en· W2064514167 sur OpenAlexaff
Wendy Vleugels, Micha A. Haeuptle, Bobby G. Ng, Jean‐Claude Michalski, Roberta Battini, Carlo Dionisi‐Vici, Mark D. Ludman, Jaak Jaeken, François Foulquier, Hudson H. Freeze, Gert Matthijs, Thierry Hennet

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensDalhousie UniversityIzaak Walton Killam Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesU.S. Public Health Service
Mots-clésMissense mutationGlycosylationBiologyDolicholMutationInternal medicineCompound heterozygosityGeneticsEndocrinologyGeneMedicineBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The medical significance of N-glycosylation is underlined by a group of inherited human disorders called Congenital Disorders of Glycosylation (CDG). One key step in the biosynthesis of the Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)-PP-dolichol precursor, essential for N-glycosylation, is the translocation of Man(5)GlcNAc(2)-PP-dolichol across the endoplasmic reticulum membrane. This step is facilitated by the RFT1 protein. Recently, the first RFT1-deficient CDG (RFT1-CDG) patient was identified and presented a severe N-glycosylation disorder. In the present study, we describe three novel CDG patients with an RFT1 deficiency. The first patient was homozygous for the earlier reported RFT1 missense mutation (c.199C>T; p.R67C), whereas the two other patients were homozygous for the missense mutation c.454A>G (p.K152E) and c.892G>A (p.E298 K), respectively. The pathogenic character of the novel mutations was illustrated by the accumulation of Man(5)GlcNAc(2)-PP-dolichol and by reduced recombinant DNase 1 secretion. Both the glycosylation pattern and recombinant DNase 1 secretion could be normalized by expression of normal RFT1 cDNA in the patients' fibroblasts. The clinical phenotype of these patients comprised typical CDG symptoms in addition to sensorineural deafness, rarely reported in CDG patients. The identification of additional RFT1-deficient patients allowed to delineate the main clinical picture of RFT1-CDG and confirmed the crucial role of RFT1 in Man(5)GlcNAc(2)-PP-dolichol translocation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,921
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman MutationMême sujetGlycosylation and Glycoproteins ResearchTravaux en français237 207