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Enregistrement W2064552877 · doi:10.1111/j.1600-0854.2009.00948.x

Sorting of MHC Class II Molecules into Exosomes through a Ubiquitin‐Independent Pathway

2009· article· en· W2064552877 sur OpenAlexaff
Marie‐Élaine Gauvreau, Marie‐Hélène Côté, Marie‐Claude Bourgeois‐Daigneault, Louis‐David Rivard, Fangming Xiu, Alexandre Brunet, Andrew Shaw, Viktor Steimle, Jacques Thibodeau

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversity of AlbertaUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCell biologyMicrovesiclesCIITAUbiquitinMajor histocompatibility complexUbiquitin ligaseMHC class ICD74MHC class IIMolecular biologyTransfectionAntigenBiochemistryImmunologymicroRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Major histocompatibility complex class II (MHC-II) molecules accumulate in exocytic vesicles, called exosomes, which are secreted by antigen presenting cells. These vesicles are released following the fusion of multivesicular bodies (MVBs) with the plasma membrane. The molecular mechanisms regulating cargo selection remain to be fully characterized. As ubiquitination of the MHC-II beta-chain cytoplasmic tail has recently been demonstrated in various cell types, we sought to determine if this post-translational modification is required for the incorporation of MHC-II molecules into exosomes. First, we stably transfected HeLa cells with a chimeric HLA-DR molecule in which the beta-chain cytoplasmic tail is replaced by ubiquitin. Western blot analysis did not indicate preferential shedding of these chimeric molecules into exosomes. Next, we forced the ubiquitination of MHC-II in class II transactivator (CIITA)-expressing HeLa and HEK293 cells by transfecting the MARCH8 E3 ubiquitin ligase. Despite the almost complete downregulation of MHC-II from the plasma membrane, these molecules were not enriched in exosomes. Finally, site-directed mutagenesis of all cytoplasmic lysine residues on HLA-DR did not prevent inclusion into these vesicles. Taken together, these results demonstrate that ubiquitination of MHC-II is not a prerequisite for incorporation into exosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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