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Enregistrement W2064631006 · doi:10.1021/bi002252i

Deletion of the Helical Motif in the Intestinal Fatty Acid-Binding Protein Reduces Its Interactions with Membrane Monolayers:  Brewster Angle Microscopy, IR Reflection-Absorption Spectroscopy, and Surface Pressure Studies

2001· article· en· W2064631006 sur OpenAlexfundno aff
Fangjun Wu, Betina Córsico, Carol R. Flach, David P. Cistola, Judith Storch, Richard Mendelsohn

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Research Council Canada
Mots-clésMonolayerBrewster's angleChemistryCrystallographyMembraneBiochemistryOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intestinal fatty acid binding protein (IFABP) appears to interact directly with membranes during fatty acid transfer [Hsu, K. T., and Storch, J. (1996) J. Biol. Chem. 271, 13317-13323]. The largely alpha-helical "portal" domain of IFABP was critical for these protein--membrane interactions. In the present studies, the binding of IFABP and a helixless variant of IFABP (IFABP-HL) to acidic monolayers of 1,2-dimyristoylphosphatidic acid (DMPA) has been monitored by surface pressure measurements, Brewster angle microscopy (BAM), and infrared reflection-absorption spectroscopy (IRRAS). Protein adsorption to DMPA exhibited a two phase kinetic process consisting of an initial slow phase, arising from protein binding to the monolayer and/or direct interfacial adsorption, and a more rapid phase that parallels formation of lipid-containing domains. IFABP exhibited more rapid changes in both phases than IFABP-HL. The second phase was absent when IFABP interacted with zwitterionic monolayers of 1,2-dipalmitoylphosphatidylcholine, revealing the important role of electrostatics at this stage. BAM images of DMPA monolayers with either protein revealed the formation of domains leading eventually to rigid films. Domains of DMPA/IFABP-HL formed more slowly and were less rigid than with the wild-type protein. Overall, the IRRAS studies revealed a protein-induced conformational ordering of the lipid acyl chains with a substantially stronger ordering effect induced by IFABP. The physical measurements thus suggested differing degrees of direct interaction between the proteins and DMPA monolayers with the IFABP/DMPA interaction being somewhat stronger. These data provide a molecular structure rationale for previous kinetic measurements indicating that the helical domain is essential for a collision-based mechanism of fatty acid transfer to phospholipid membranes [Corsico, B., Cistola, D. P., Frieden, C. and Storch, J. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 12174-12178].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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