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Enregistrement W2064633787 · doi:10.1073/pnas.0610481104

A mechanism for transcriptional repression dependent on the BRCA1 E3 ubiquitin ligase

2007· article· en· W2064633787 sur OpenAlexaff
Andrew A. Horwitz, El Bachir Affar, George F. Heine, Yang Shi, Jeffrey D. Parvin

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthU.S. Department of Defense
Mots-clésUbiquitin ligaseUbiquitin-conjugating enzymeCoactivatorUbiquitinBiologyCell biologyGeneral transcription factorRepressorTranscription factorPsychological repressionTranscription factor II ATranscription preinitiation complexMolecular biologyPromoterGeneticsGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Loss of function of the tumor suppressor protein BRCA1 is responsible for a high percentage of familial and also sporadic breast cancers. Early work identified a stimulatory transcriptional coactivator function for the BRCA1 protein, and more recently, BRCA1 has been implicated in transcriptional repression, although few examples of repressed genes have been characterized. We recently used an in vitro transcription assay to identify a biochemical mechanism that explained the BRCA1 stimulatory activity. In this study, we identified an ubiquitin-dependent mechanism by which BRCA1 inhibits transcription. BRCA1 ubiquitinates the transcriptional preinitiation complex, preventing stable association of TFIIE and TFIIH, and thus blocks the initiation of mRNA synthesis. What is striking about this mechanism of regulation by BRCA1 is that the ubiquitination of the preinitiation complex is not targeting proteins for degradation by the proteasome, nor are ubiquitin receptors modifying the activity, but rather the ubiquitin moiety itself interferes with the assembly of basal transcription factors at the promoter. Using RNAi to knockdown expression of the endogenous BRCA1 protein, we assessed the level of repression dependent on BRCA1 in the cell, and we found that BRCA1 is at least as significant a transcriptional repressor as it is an activator. These results define a biochemical mechanism by which the BRCA1 enzymatic activity regulates a key cellular process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,163
Score d'incertitude au seuil0,195

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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