Genetic differentiation of charcoal rot pathogen,<i>Macrophomina phaseolina</i>, into specific groups using URP-PCR
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Forty isolates of Macrophomina phaseolina, a pathogen causing charcoal dry root rot of soybean, cotton, and chickpea, were genetically characterized with universal rice primers (URP; primers derived from DNA repeat sequences in the rice genome) using polymerase chain reaction (URP-PCR). Out of 12 URPs used in this study, 5 primers were effective in producing polymorphic fingerprint patterns from the DNA of M. phaseolina isolates. Three primers (URP-2F, URP-6R, and URP-30F) were quite informative and produced high levels of polymorphism among the isolates of M. phaseolina. Analysis of the entire fingerprint profiles using unweighted pair-group method with arithmetic averages (UPGMA) clearly differentiated M. phaseolina isolates obtained from soybean, cotton, and chickpea hosts into specific groups. In this study, we found for the first time transferability and use of PCR primers derived from plant genomes to generate host-specific fingerprint profiles of M. phaseolina, a broad host range plant pathogenic fungus. These results demonstrate that URPs are sensitive and technically simple to use for assaying genetic variability in M. phaseolina populations.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle