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Enregistrement W2064714694 · doi:10.1074/jbc.m512700200

Regions of the Catalytic α Subunit of Na,K-ATPase Important for Functional Interactions with FXYD 2

2006· article· en· W2064714694 sur OpenAlexaff
Athina Zouzoulas, Rhoda Blostein

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein subunitCatalysisATPaseChemistryBiophysicsBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gamma modulator (FXYD 2) is a member of the FXYD family of single transmembrane proteins that modulate the kinetic behavior of Na,K-ATPase. This study concerns the identification of regions in the alpha subunit that are important for its functional interaction with gamma. An important effect of gamma is to increase K+ antagonism of cytoplasmic Na+ activation apparent as an increase in KNa' at high [K+]. We show that although gamma associates with alpha1, alpha2, and alpha3 isoforms, it increases the KNa' of alpha1 and alpha3 but not alpha2. Accordingly, chimeras of alpha1 and alpha2 were used to identify regions of alpha critical for the increased KNa'. As with alpha1 and alpha2, all chimeras associate with gamma. Kinetic analysis of alpha2front/alpha1back chimeras indicate that the C-terminal (Lys907-Tyr1018) region of alpha1, which includes transmembrane (TM)9 close to gamma, is important for the increase in KNa'. However, similar experiments with alpha1front/alpha2back chimeras indicate a modulatory role of the loop between TMs 7 and 8. Thus, as long as the alpha1 L7/8 loop is present, replacement of TM9 of alpha1 with that of alpha2 does not abrogate the gamma effect on KNa'. In contrast, as long as TM9 is that of alpha1, replacement of L7/8 of alpha1 with that of alpha2 does not abolish the effect. It is suggested that structural association of the TM regions of alpha and FXYD 2 is not the sole determinant of this effect of FXYD on KNa' but is subject to long range modulation by the extramembranous L7/8 loop of alpha.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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