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Enregistrement W2064794919 · doi:10.1002/ajmg.a.34260

Correlation of intercentromeric distance, mosaicism, and sexual phenotype: Molecular localization of breakpoints in isodicentric Y chromosomes

2011· article· en· W2064794919 sur OpenAlexafffund
Mélanie Beaulieu Bergeron, Pierre Brochu, Emmanuelle Lemyre, Nicole Lemieux

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesFondation des Etoiles
Mots-clésBiologyBreakpointGeneticsChromosomeKaryotypePhenotypeDicentric chromosomeY chromosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isodicentric chromosomes are among the structural abnormalities of the Y chromosome that are commonly identified in patients. The simultaneous 45,X cell line that is generated in cell division due to instability of the isodicentric Y chromosome [idic(Y)] has long been hypothesized to explain the variable sexual development of these patients, although gonads have been studied in only a subset of cases. We report here on the molecular localization of breakpoints in ten patients with an idic(Y). Breakpoints were mapped by FISH using BACs; gonads and fibroblasts were also analyzed when possible to evaluate the level of mosaicism. First, we demonstrate great tissue variability in the distribution of idic(Y). Second, palindromes and direct repeats were near the breakpoint of several idic(Y), suggesting that these sequences play a role in the formation of idic(Y). Finally, our data suggest that intercentromeric distance has a negative influence on the stability of idic(Y), as a greater proportion of cells with breakage or loss of the idic(Y) were found in idic(Y) with a greater intercentromeric distance. Females had a significantly greater intercentromeric distance on their idic(Y) than did males. In conclusion, our study indicates that the Y chromosome contains sequences that are more prone to formation of isodicentric chromosomes. We also demonstrate that patients with an intercentromeric distance greater than 20 Mb on their idic(Y) are at increased risk of having a female sexual phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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