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Enregistrement W2064813006 · doi:10.1094/pdis.2002.86.8.921c

First Report of Pink Seed of Common Bean Caused by <i>Erwinia rhapontici</i>

2002· article· en· W2064813006 sur OpenAlexaffabout
Hsiao‐Wen Huang, R. S. Erickson, L. J. Yanke, H.‐H. Mündel, T. F. Hsieh

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRaffinoseRhamnoseSalicinMelibioseFood scienceBotanyCellobioseArbutinFructoseMannitolBiochemistrySucroseGalactoseHydrolysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2001, a new disease of common bean (Phaseolus vulgaris L.) caused by Erwinia rhapontici (Millard) Burkh. was detected in seed samples from southern Alberta, Canada. Infected seeds had pink or pinkish-brown lesions on the seed coat. The disease was found in great northern (cv. US1140), pink (cv. Viva), and pinto (cv. Othello) beans at low (&lt;0.1%) frequencies. Isolation from surface-sterilized pink seeds resulted in bacterial cultures, which produced a water-soluble pink pigment on potato dextrose agar (PDA). Seven isolates were tested for physiological characteristics using conventional tests (1) and API 50CHE test strips (bioMérieux Canada, St. Laurent, Quebec), and tested for cellular fatty acids using the MIDI system (Newark, DE). All isolates were gram-negative, motile, facultative anaerobic rods with mucoid colonies and produced a pink pigment on PDA. They were positive for citrate utilization, catalase, methyl red, and Voges-Proskauer, and negative for arginine dihydrolase, lysine and ornithine decarboxylases, urease, gelatin liquification, indole production, oxidase, and gas production. Fatty acid profiles matched with E. rhapontici (approximately 30% each 16:0 and 16:1 ω7c/15:0 iso 2OH; 12% 18:1 ω7c: 8% each 17:0 cyclo and 14:0 3OH/16:1 iso; 4 to 5% each 12:0 and 14:0). Isolates were positive for acid production from: N-acetyl glucosamine, l-arabinose, amygdalin, arbutin, cellobiose, esculin (hydrolysis), d-fructose, d-fucose, d-galactose, β-gentiobiose, d-glucose, glycerol, i-myo-inositol, lactose, maltose, d-mannitol, d-mannose, melibiose, d-raffinose, l-rhamnose, ribose, salicin, d-sorbitol, sucrose, trehalose, and d-xylose. These results match published results for E. rhapontici (4). For pathogenicity tests, each isolate was inoculated in 30 pods from six bean plants (cv. US1140) as described for pink seed of peas (2). Each pod was inoculated with 0.1 ml of bacterial suspension, approximately 10 9 CFU/ml, by injection through the mid-rib at the basal end. The same number of uninoculated and water-inoculated pods served as controls. Plants were kept in the greenhouse (20 ± 5°C) for 4 weeks, after which isolations were done as described above. In duplicate experiments, all isolates caused lesions on pods extending up to 5 cm from the inoculation point with corresponding discoloration of seeds. The frequency of infected seeds varied among isolates, ranging from 20 to 50%. E. rhapontici was reisolated from seeds with lesions, but not asymptomatic seeds. The study concludes that pink seed of common bean is due to E. rhapontici, a pathogen previously reported on peas in Alberta, Canada (2), and Montana (3). References: (1) D. J. Brenner. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol.1, Williams and Wilkens, Baltimore, MD, 1984. (2) H. C. Huang et al. Can. J. Plant Pathol. 12:445, 1990. (3) B. K. Schroeder et al. Plant Dis. 86:188, 2002. (4) L. Verdonck et al. Int. J. Syst. Bacteriol. 37:4, 1987.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,760
Score d'incertitude au seuil0,227

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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