Selectable marker genes and unintended changes to the plant transcriptome
Notice bibliographique
Résumé
The intended effect of a selectable marker gene is to confer a novel trait that allows for the selection and recovery of transgenic plants. Unintended effects may also occur as a result of interactions between the selectable marker gene or its regulatory elements and genetic elements at the site of insertion. These are called position effects. Other unintended effects may occur if the selectable marker gene has a range of pleiotropic effects related to the functional and regulatory domains within the coding region or the regulatory elements used to drive expression. Both pleiotropic and position effects may generate unpredictable events depending on the process used for transgenesis and the state of knowledge associated with the selectable marker gene. Although some selectable marker genes, such as the neomycin phosphotransferase type II gene (nptII), have no pleiotropic effects on the transcriptomes of transgenic plants, others, such as the bialaphos resistance gene (bar), have pleiotropic effects. These must be clearly understood and accounted for when evaluating the expression patterns conferred by other co-transforming transgenes under study. The number and kinds of selectable marker genes are large. A detailed understanding of their unintended effects is needed to develop transgenic strategies that will minimize or eliminate unintended and unpredictable changes to plants with newly inserted genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».