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Enregistrement W2064896115 · doi:10.1111/j.1467-7652.2009.00400.x

Selectable marker genes and unintended changes to the plant transcriptome

2009· review· en· W2064896115 sur OpenAlex
Brian Miki, Ashraf Abdeen, Yuzuki Manabe, Phil Macdonald

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePlant Biotechnology Journal · 2009
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant tissue culture and regeneration
Établissements canadiensCanadian Food Inspection AgencyAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTranscriptomeGeneSelectable markerComputational biologyGeneticsGene expressionTransgene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The intended effect of a selectable marker gene is to confer a novel trait that allows for the selection and recovery of transgenic plants. Unintended effects may also occur as a result of interactions between the selectable marker gene or its regulatory elements and genetic elements at the site of insertion. These are called position effects. Other unintended effects may occur if the selectable marker gene has a range of pleiotropic effects related to the functional and regulatory domains within the coding region or the regulatory elements used to drive expression. Both pleiotropic and position effects may generate unpredictable events depending on the process used for transgenesis and the state of knowledge associated with the selectable marker gene. Although some selectable marker genes, such as the neomycin phosphotransferase type II gene (nptII), have no pleiotropic effects on the transcriptomes of transgenic plants, others, such as the bialaphos resistance gene (bar), have pleiotropic effects. These must be clearly understood and accounted for when evaluating the expression patterns conferred by other co-transforming transgenes under study. The number and kinds of selectable marker genes are large. A detailed understanding of their unintended effects is needed to develop transgenic strategies that will minimize or eliminate unintended and unpredictable changes to plants with newly inserted genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,909
Score d'incertitude au seuil0,861

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle