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Enregistrement W2064905859 · doi:10.1074/jbc.m800364200

Molecular Identification of a Novel Mammalian Brain Isoform of Acyl-CoA:Lysophospholipid Acyltransferase with Prominent Ethanolamine Lysophospholipid Acylating Activity, LPEAT2

2008· article· en· W2064905859 sur OpenAlexaff
Jingsong Cao, Dandan Shan, Tracy Revett, Dongmei Li, Leeying Wu, Wei Liu, James F. Tobin, Ruth E. Gimeno

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensWomen's Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLysophosphatidylethanolamineAcyltransferasesBiochemistryAcyltransferaseAcyl-CoALysophosphatidylcholinePhosphatidylethanolaminePhospholipidBiologyEndoplasmic reticulumLysophosphatidic acidAutotaxinChemistryEnzymeBiosynthesisPhosphatidylcholine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acyl-CoA-dependent lysophospholipid acyltransferases play an important role in attaining the appropriate molecular species of phospholipids. A number of genes encoding these activities were recently identified. It has become clear that multiple genes can encode one enzymatic activity and that a given gene may encode multiple activities. Here we report the identification of a gene encoding a mammalian acyl-CoA-dependent lysophospholipid acyltransferase with prominent activity toward ethanolamine-containing lysophospholipids, which we termed acyl-CoA:lysophosphatidylethanolamine acyltransferase 2, LPEAT2 (previously annotated as AYTL3 or AGPAT7). LPEAT2 is predominantly expressed in brain, coinciding with an enrichment of phosphatidylethanolamine in this tissue. Ectopic expression of LPEAT2 in mammalian HEK293T cells led to a dramatic increase (up to 9-fold) in LPEAT activity when compared with cells transfected with empty vector or an unrelated acyltransferase. LPEAT2 also exhibited significant acyl-CoA-dependent acyltransferase activity toward 1-O-alkenyl-lysophosphatidylethanolamine, lysophosphatidylglycerol, 1-O-alkyl-lysophosphatidylcholine, lysophosphatidylserine, and lysophosphatidylcholine but lacked appreciable acylating activity toward glycerol 3-phosphate, lysophosphatidic acid, lysophosphatidylinositol, and diacylglycerol, demonstrating multiple but selective functions of LPEAT2 as an enzyme involved in phospholipid remodeling. LPEAT2 recognizes a broad range of medium and long chain fatty acyl-CoA, and its activity was not affected by Ca(2+). When overexpressed in mammalian cells, LPEAT2 is localized to the endoplasmic reticulum. siRNA-mediated knockdown of LPEAT2 in HEK293T cells significantly decreased LPEAT and 1-alkenyl-LPEAT activities but did not affect other lysophospholipid acylating activities. These findings identify LPEAT2 as an important enzyme in the biosynthesis of ethanolamine-containing phospholipids, especially in brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,921

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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