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Enregistrement W2064911343 · doi:10.3732/ajb.0800079

Polyploidy and angiosperm diversification

2009· article· en· W2064911343 sur OpenAlexaff
Pamela S. Soltis, Victor A. Albert, Jim Leebens‐Mack, Charles D. Bell, Andrew H. Paterson, Chunfang Zheng, David Sankoff, Claude W. de Pamphilis, P. Kerr Wall

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPolyploidEudicotsEvolutionary biologyLineage (genetic)GenomePhylogenomicsFabaceaePhylogenetic treePhylogeneticsPlant evolutionCladeAdaptive radiationBotanyGeneticsTaxonomy (biology)Gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polyploidy has long been recognized as a major force in angiosperm evolution. Recent genomic investigations not only indicate that polyploidy is ubiquitous among angiosperms, but also suggest several ancient genome-doubling events. These include ancient whole genome duplication (WGD) events in basal angiosperm lineages, as well as a proposed paleohexaploid event that may have occurred close to the eudicot divergence. However, there is currently no evidence for WGD in Amborella, the putative sister species to other extant angiosperms. The question is no longer "What proportion of angiosperms are polyploid?", but "How many episodes of polyploidy characterize any given lineage?" New algorithms provide promise that ancestral genomes can be reconstructed for deep divergences (e.g., it may be possible to reconstruct the ancestral eudicot or even the ancestral angiosperm genome). Comparisons of diversification rates suggest that genome doubling may have led to a dramatic increase in species richness in several angiosperm lineages, including Poaceae, Solanaceae, Fabaceae, and Brassicaceae. However, additional genomic studies are needed to pinpoint the exact phylogenetic placement of the ancient polyploidy events within these lineages and to determine when novel genes resulting from polyploidy have enabled adaptive radiations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 287
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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