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Enregistrement W2064921593 · doi:10.1080/07060660809507540

Occurrence of pyrrocidine and dihydroresorcylide production among<i>Acremonium zeae</i>populations from maize grown in different regions

2008· article· en· W2064921593 sur OpenAlexvenueno aff
Donald T. Wicklow, Stephen M. Poling, Richard C. Summerbell

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAcremoniumMyceliumPotato dextrose agarMycotoxinEndophyteZea maysHorticulturePoaceaeTemperate climateAgarBotanyAgronomyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acremonium zeae is recognized as a protective endophyte of maize (Zea mays). Thus, it is a potential confounding variable in maize variety trials for resistance to pathogenic microbes and their mycotoxins. This fungus grows systemically in maize and produces pyrrocidines A and B, polyketide – amino acid derived antibiotics exhibiting potent in vitro activity against major stalk- and ear-rot pathogens of maize. An evaluation of a number of A. zeae isolates accessioned by the USDA Agricultural Research Service Culture Collection (NRRL) and CBS Culture Collections from 1969 to 1992 revealed that pyrrocidines were produced by 5 of 11 isolates from maize grown in regions sharing a milder temperate climate with cold winters (e.g., Illinois, Nebraska, and Germany) and by 10 of 12 isolates from maize grown in warmer regions (e.g., North Carolina and Georgia, USA; Iran; and India). Cultures of A. zeae representing 13 populations isolated from maize seeds harvested from different regions and years were grown on potato dextrose agar in Petri dishes. Excised portions of the developing colony and underlying agar were extracted and analyzed by liquid chromatography – atmospheric pressure chemical ionization interface – mass spectrometry. Among 52 isolates representing four A. zeae populations from regions associated with drought and temperature stress (e.g., Arizona, California, and Texas) 49 isolates (94%) produced pyrrocidine A in amounts ranging from 1 to 248 ng (mean 29 ng), and 51 isolates (98%) produced pyrrocidine B in amounts ranging from 2 to 440 ng (mean 137 ng). In contrast, among 102 isolates representing nine A. zeae populations from the midwestern corn belt (e.g., Illinois, Indiana, Iowa, Kentucky, Michigan, and Nebraska), only one isolate produced pyrrocidine A (280 ng) and pyrrocidine B (411 ng). During the population study, a new secondary metabolite of A. zeae, dihydroresorcylide, was discovered, and its distribution among the population is described. Clonal populations of A. zeae endophytes differing in their ability to produce pyrrocidines may be distributed with seed of maize cultivars grown in commercial plantings. Key words: Acremonium zeae, blackened bundles, cerebroside, dihydroresorcylide, disease suppression, endophyte, maize, polyketide antibiotics, pyrrocidines, stress damage, seedborne. Acremonium zeae est reconnu en tant que champignon endophyte protecteur du maïs. Il s’agit par conséquent d’un facteur confusionnel potentiel dans les essais de variété effectués sur le maïs afin d’en évaluer la résistance aux microbes pathogènes et à leurs mycotoxines. A. zeae pousse systématiquement sur le maïs et produit des pyrrocidines A et B, c’est-à-dire des antibiotiques polykétides dérivés d’acides aminés qui affichent une forte activité in vitro contre les principaux agents pathogènes causant la fusariose de l’épi et la pourriture des tiges chez le maïs. Une évaluation d’un nombre d’isolats d’ A. zeae, répertoriés, de 1969 à 1992, par l’Agricultural Research Service Culture Collection NRRL et le CBS Culture Collection a démontré que 5 des 11 isolats obtenus de plants de maïs cultivés dans des régions qui connaissent des étés doux et des hivers froids (p. ex., Illinois, Nebraska, Allemagne) produisaient des pyrrocidines, de même que 10 des 12 isolats cultivés dans des régions plus chaudes (p. ex., Caroline du Nord et Géorgie, États-Unis; Iran; Inde). Afin de les faire croître, des cultures d’ A. zeae, représentant 13 populations isolées à partir de semences de maïs récoltées dans diverses régions et au cours d’années différentes, ont été placées dans des boîtes de Pétri sur de la gélose dextrosée à la pomme de terre. Des portions isolées de colonies et de gélose sous-jacente ont été extraites et analysées par LC-APCI-MS. Parmi les 52 isolats représentant 4 populations d’ A. zeae provenant de régions associées aux stress causés par la sécheresse et la température (p. ex., Arizona, Californie, Texas), 49 isolats (94 %) ont produit de la pyrrocidine A en quantité variant de 1 à 248 ng (moyenne de 29 ng) et 51 isolats (98 %) ont produit de la pyrrocidine B dont les quantités variaient de 2 à 440 ng (moyenne de 137 ng). Par ailleurs, parmi les 102 isolats représentant 9 populations d’ A. zeae issues de la ceinture de maïs des États du Midwest (p. ex., Illinois, Indiana, Iowa, Kentucky, Michigan, Nebraska), un seul isolat a produit de la pyrrocidine A (280 ng) et de la pyrrocidine B (411 ng). Au cours de l’étude de populations, un nouveau métabolite secondaire d’ A. zeae, le dihydroresorcylide, a été découvert et l’on décrit sa distribution dans la population. Des semences de cultivars de maïs cultivées commercialement peuvent contenir des populations clonales d’endophytes d’ A. zeae dont la capacité à produire des pyrrocidines est variable. Mots-clés : Acremonium zeae, maladie des faisceaux noirs, cérébroside, dihydroresorcylide, suppression des maladies, endophyte, antibiotiques polykétides, pyrrocidines, dommages dus au stress, transmis par semence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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