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Enregistrement W2065340700 · doi:10.1016/j.jasms.2010.05.008

Carbamino group formation with peptides and proteins studied by mass spectrometry

2010· article· en· W2065340700 sur OpenAlexaff
Péran Terrier, D. J. Douglas

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society for Mass Spectrometry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAdductMass spectrometryElectrospray ionizationBradykininElectrosprayPeptideChromatographyAmino acidDissociation (chemistry)Analytical Chemistry (journal)Organic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

At high pH and in the presence of dissolved CO(2), the N-terminus and epsilon-amino groups of amino acids, peptides, and proteins can form carbamino adducts with CO(2), R-NH(2) + CO(2) <--> R-NHCOO(-) + H(+). We report the first study of carbamino group formation by electrospray ionization (ESI) mass spectrometry (MS). Angiotensin II, bradykinin, substance P, and insulin have been studied. A careful optimization of the instrumental parameters was necessary to allow the transfer of the fragile adducts into vacuum for mass analysis. Particularly, dissociation of the adducts in the ion sampling process and pH changes in ESI must be minimized. With these precautions, levels of carbamino group formation of angiotensin II and bradykinin determined from mass spectra agree with those expected to be in solution, calculated from literature equilibrium constants. Thus, ESI MS can quantitatively measure ratios of carbamino adduct to total peptide concentration in solution. Values of equilibrium constants for carbamino group formation with substance P (pK(c) = 4.77 +/- 0.18) and insulin (pK(c) = 4.99 +/- 0.05) are reported for the first time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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