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Enregistrement W2065385849 · doi:10.1186/s13104-015-1051-x

Validity of calendar day-based definitions for community-onset bloodstream infections

2015· article· en· W2065385849 sur OpenAlexaff
Kevin B. Laupland, Daniel B. Gregson, Deirdre L. Church

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensUniversity of CalgaryRoyal Inland Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGold standard (test)Bloodstream infectionPediatricsCohortPopulationBlood cultureEmergency medicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Community-onset (CO) bloodstream infections (BSI) are those BSI where the blood culture is drawn <48 hours from hospital admission. However, exact times of culture draw or hospital admission are not always available. We evaluated the validity of using 2- or 3- calendar day based definitions for CO-BSI by comparing to a "gold standard" 48-hour definition. FINDINGS: Among the population-based cohort of 14,106 episodes of BSI studied, 10,543 were classified as CO based on "gold standard" 48-hour criteria. When 2-day and 3-day definitions were applied, 10,396 and 10,707 CO-BSI episodes were ascertained, respectively. All but 147 (1.4%) true CO-BSI cases were included by using the 2-day definition. When the 3-day definition was applied, all cases of CO-BSI were identified but and additional 164 (1.5%) cases of hospital-onset HO-BSI were also included. Thus the sensitivity and specificity of the 2-day definition was 98.6% and 100% and for the 3-day definition was 100% and 98.5%, respectively. Overall, only 311 (2.2%) cases were potentially miss-classifiable using either the 2- or 3-calendar day based definitions. CONCLUSIONS: Use of either a 2- or 3-day definition is highly accurate for classifying CO-BSI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,031
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,106
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,165

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0310,106
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,499
Tête enseignante GPT0,452
Écart entre enseignants0,047 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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