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Enregistrement W2065401088 · doi:10.1139/w2012-107

<i>Caenorhabditis elegans</i>avoids staphylococcal superantigenic toxins via 5-hydroxytryptamine-dependent pathway

2012· article· en· W2065401088 sur OpenAlexvenueno aff
Arihiro Osanai, Dong‐Liang Hu, Akio Nakane

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHirosaki University
Mots-clésCaenorhabditis elegansBiologyMicrobiologyMutantToxinEnterotoxinStaphylococcus aureusBacteriaSuperantigenNematodeEscherichia coliGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Avoidance behavior of Caenorhabditis elegans, a nematode, towards Staphylococcus aureus, a pathogenic bacterium, was studied. Caenorhabditis elegans avoided S. aureus cultures and also their culture supernatants, suggesting that secretory molecules are involved in the repellent activity. We demonstrated that toxic shock syndrome toxin 1 (TSST-1) and staphylococcal enterotoxin C (SEC), the superantigenic toxins produced by S. aureus, are responsible for the nematode avoidance. By using TSST-1 and SEC mutants, the results indicated that the repellent activity of these toxins is independent of their superantigenic activity. The TSST-1 and SEC were found to locate at chemosensory neurons that are responsible for the recognition of repellents and avoidance of pathogenic bacteria. When mutants of C. elegans deficient in Toll/interleukin-1 receptor (TIR-1) and 5-hydroxytryptamine (5-HT) biosynthesis were used, avoidance behavior was attenuated. In the 5-HT biosynthesis deficient mutant nematodes, the avoidance activity was recovered when exogenous 5-HT was added. tph-1 expression and 5-HT production were upregulated when the nematodes were treated with TSST-1 or SEC. These results suggest that C. elegans avoids S. aureus by recognizing secretory molecules including TSST-1 and SEC and this avoidance is dependent on TIR and production of 5-HT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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