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Enregistrement W2065461128 · doi:10.3389/fphys.2013.00168

Using neurolipidomics to identify phospholipid mediators of synaptic (dys)function in Alzheimer's Disease

2013· article· en· W2065461128 sur OpenAlexafffund
Steffany A. L. Bennett, Nicolas Valenzuela, Hongbin Xu, Bettina Franko, Stephen Fai, Daniel Figeys

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchOntario Innovation Trust
Mots-clésPhospholipidCell biologyBiogenesisBiologyPlasmalogenMetabolismNeurodegenerationBiochemistryFunction (biology)NeuroscienceChemistryMembraneInternal medicineDiseaseMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Not all of the mysteries of life lie in our genetic code. Some can be found buried in our membranes. These shells of fat, sculpted in the central nervous system into the cellular (and subcellular) boundaries of neurons and glia, are themselves complex systems of information. The diversity of neural phospholipids, coupled with their chameleon-like capacity to transmute into bioactive molecules, provides a vast repertoire of immediate response second messengers. The effects of compositional changes on synaptic function have only begun to be appreciated. Here, we mined 29 neurolipidomic datasets for changes in neuronal membrane phospholipid metabolism in Alzheimer's Disease (AD). Three overarching metabolic disturbances were detected. We found that an increase in the hydrolysis of platelet activating factor precursors and ethanolamine-containing plasmalogens, coupled with a failure to regenerate relatively rare alkyl-acyl and alkenyl-acyl structural phospholipids, correlated with disease severity. Accumulation of specific bioactive metabolites [i.e., PC(O-16:0/2:0) and PE(P-16:0/0:0)] was associated with aggravating tau pathology, enhancing vesicular release, and signaling neuronal loss. Finally, depletion of PI(16:0/20:4), PI(16:0/22:6), and PI(18:0/22:6) was implicated in accelerating Aβ42 biogenesis. Our analysis further suggested that converging disruptions in platelet activating factor, plasmalogen, phosphoinositol, phosphoethanolamine (PE), and docosahexaenoic acid metabolism may contribute mechanistically to catastrophic vesicular depletion, impaired receptor trafficking, and morphological dendritic deformation. Together, this analysis supports an emerging hypothesis that aberrant phospholipid metabolism may be one of multiple critical determinants required for Alzheimer disease conversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,446
Score d'incertitude au seuil0,739

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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