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Enregistrement W2065470460 · doi:10.1021/bi3003007

Structural and Functional Consequences of the Cardiac Troponin C L48Q Ca<sup>2+</sup>-Sensitizing Mutation

2012· article· en· W2065470460 sur OpenAlexafffund
Dan Wang, Ian M. Robertson, Monica X. Li, Michelle E. McCully, Melissa L. Crane, Zhaoxiong Luo, An-Yue Tu, Valerie Daggett, Brian D. Sykes, Michael Regnier

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiophysicsMyofilamentChemistryTroponin CTroponin IContraction (grammar)MutationMolecular dynamicsConformational changeActinBiochemistryBiologyInternal medicineMedicineEndocrinologyComputational chemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium binding to the regulatory domain of cardiac troponin C (cNTnC) causes a conformational change that exposes a hydrophobic surface to which troponin I (cTnI) binds, prompting a series of protein-protein interactions that culminate in muscle contraction. A number of cTnC variants that alter the Ca(2+) sensitivity of the thin filament have been linked to disease. Tikunova and Davis engineered a series of cNTnC mutations that altered Ca(2+) binding properties and studied the effects on the Ca(2+) sensitivity of the thin filament and contraction [Tikunova, S. B., and Davis, J. P. (2004) J. Biol. Chem. 279, 35341-35352]. One of the mutations they engineered, the L48Q variant, resulted in a pronounced increase in the cNTnC Ca(2+) binding affinity and Ca(2+) sensitivity of cardiac muscle force development. In this work, we sought structural and mechanistic explanations for the increased Ca(2+) sensitivity of contraction for the L48Q cNTnC variant, using an array of biophysical techniques. We found that the L48Q mutation enhanced binding of both Ca(2+) and cTnI to cTnC. Nuclear magnetic resonance chemical shift and relaxation data provided evidence that the cNTnC hydrophobic core is more exposed with the L48Q variant. Molecular dynamics simulations suggest that the mutation disrupts a network of crucial hydrophobic interactions so that the closed form of cNTnC is destabilized. The findings emphasize the importance of cNTnC's conformation in the regulation of contraction and suggest that mutations in cNTnC that alter myofilament Ca(2+) sensitivity can do so by modulating Ca(2+) and cTnI binding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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