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Enregistrement W2065537854 · doi:10.1038/ismej.2014.89

Can marine bacteria be recruited from freshwater sources and the air?

2014· article· en· W2065537854 sur OpenAlexaff
Jérôme Comte, Eva S. Lindström, Alexander Eiler, Silke Langenheder

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesSvenska Forskningsrådet FormasVetenskapsrådetStiftelsen för Strategisk ForskningUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceWenner-Gren Stiftelserna
Mots-clésBiological dispersalBiologyEcologyGeneralist and specialist speciesPelagic zoneTaxonHabitatSedimentNicheMarine habitatsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is now clear evidence that microorganisms present biogeographic patterns, yet the processes that create and maintain them are still not well understood. In particular, the contribution of dispersal and its exact impact on local community composition is still unclear. For example, dispersing cells may not thrive in recipient environments, but may still remain part of the local species pool. Here, we experimentally tested if marine bacteria can be retrieved from freshwater communities (pelagic and sediment) and the atmosphere by exposing bacteria from three lakes, that differ in their proximity to the Norwegian Sea, to marine conditions. We found that the percentage of freshwater taxa decreased with increasing salinities, whereas marine taxa increased along the same gradient. Our results further showed that this increase was stronger for lake and sediment compared with air communities. Further, significant increases in the average niche breadth of taxa were found for all sources, and in particular lake water and sediment communities, at higher salinities. Our results therefore suggests that marine taxa can readily grow from freshwater sources, but that the response was likely driven by the growth of habitat generalists that are typically found in marine systems. Finally, there was a greater proportion of marine taxa found in communities originating from the lake closest to the Norwegian Sea. In summary, this study shows that the interplay between bacterial dispersal limitation and dispersal from internal and external sources may have an important role for community recovery in response to environmental change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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