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Enregistrement W2065802387 · doi:10.1093/intimm/14.4.347

Mutant MHC class I molecules define interactions between components of the peptide‐loading complex

2002· article· en· W2065802387 sur OpenAlex
Marie-Ève Paquet, David B. Williams

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueInternational Immunology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaGovernment of Ontario
Mots-clésCalnexinCalreticulinTransporter associated with antigen processingEndoplasmic reticulumMHC class ICell biologyChemistryMajor histocompatibility complexMutantPeptideBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Class I histocompatibility molecules, consisting of a heavy chain, beta2-microglobulin and peptide, are assembled in the endoplasmic reticulum (ER) with the assistance of several molecular chaperones and accessory proteins. Peptide binding occurs when assembling class I molecules associate with a loading complex consisting of the transporter associated with antigen processing (TAP) peptide transporter, tapasin, ERp57 and calreticulin (CRT)/calnexin. To assess the physical organization of this complex, we generated a series of mutants in the murine H-2Dd heavy chain and assessed their association with components of the complex. Seven mutations, clustered between amino acids 122 and 136 in the heavy chain alpha2 domain plus one mutation at position 222 in the alpha3 domain, resulted in loss of interaction with tapasin. Association with TAP was always lost simultaneously, supporting the view that tapasin acts as an obligatory bridge between class I molecules and TAP. Compared with previous studies on the HLA-A2 molecule, some differences in points of tapasin interaction were observed. Failure of the H-2Dd mutants to bind tapasin resulted in low cell-surface expression and altered intracellular transport. Most mutants retained a substantial degree of peptide loading, consistent with the view that although tapasin may promote peptide binding to class I, it is not required. A surprising observation was that all mutants lacking tapasin interaction retained normal association with CRT. This contrasts with previous observations on other class I molecules and, combined with differences in tapasin interaction, suggests that the organization of the ER peptide-loading complex can vary depending on the specific class I molecule examined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle