Phylogeography, genetic isolation, and migration of deep-sea fishes in the South Atlantic
Notice bibliographique
Résumé
According to the comparative analysis of spatial patterns of the genetic variation at cox1 mtDNA in bathy- and mesopelagic fish (Myctophidae, Sternoptychidae, Gonostomatidae, Phosichthydae) inhabiting the South Atlantic the species under study are divided into two groups. The division takes place at the levels of families, subfamilies, and genera. The first group (“migrants”) is characterized by low indices of genetic diversity and lack of spatial divergence. In the second group (“resident” species), the genetic diversity is much higher and haplotypes are segregated into separate clades with a clear regional localization (on the scale <400 km). The main barrier for genetic migration coincides with the hydrographic boundary between the subtropical gyre and the South Equatorial Current at depths below 400 m. The considered mechanisms for passive transfer regulation use vertical physical factors, which are associated primarily with adaptations of the species to different trophic niches. It is assumed that “migrants,” which are probably less specialized species, may take advantage of the passive transfer for better spreading along their ranges, while in “resident” species, restricted migration may help to preserve local adaptations in populations. A deep spatial genetic divergence, considering the previously detected ecomorphological heterogeneity, allows one to treat some “resident” species as polytypic and to advance the taxonomy rank of certain populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».