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Enregistrement W2065962918 · doi:10.1242/jeb.081653

ROOT HAEMOGLOBINS BENEFIT FISH ON ACID

2013· article· en· W2065962918 sur OpenAlexaboutno aff
Cosima S. Porteus

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxygenBiologyMetabolismBiochemistrySwim bladderFish <Actinopterygii>OxygenationChemistryEcologyFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Haemoglobin, the oxygen-carrying protein in our red blood cells, binds oxygen at the lungs and releases oxygen at the tissues to sustain metabolic needs and, thus, life. In nearly all vertebrates, carbon dioxide, a product of metabolism, helps haemoglobin release oxygen at the tissues by acidifying red blood cells. Bony fish have ‘Root haemoglobins’ – special haemoglobins that are more pH sensitive than those of other vertebrates. Root haemoglobins help fish deliver oxygen to the retina and gas bladder, two extremely oxygen-demanding tissues. These tissues have specialized acid-producing cells that help them get lots of oxygen from haemoglobin. Other tissues do not have acid-producing cells, but is there a way that these other tissues can take advantage of the sensitivity to pH of Root haemoglobins in order to get more oxygen? Jodie Rummer from the University of British Columbia, Canada, and her colleagues recently discovered the answer to this question and their findings are published in Science.First, Rummer and colleagues wanted to determine whether they could make fish muscles pick up more oxygen by simply making their blood more acidic. They monitored the oxygen level in trout muscle in real-time by inserting a very small probe into the muscle. Even though they applied only a moderate acid stress, the oxygen in the muscle increased by 65% and there was an approximate doubling in the delivery of oxygen to that muscle. The team calculated that Root haemoglobins are 20 times more efficient at delivering oxygen to a fish's muscle than human haemoglobins are at delivering oxygen to our own working muscles!Fish red blood cells contain an acid pump that can pump out acid from the red blood cell, increasing pH inside the red blood cell, and making haemoglobin better able to pick up oxygen at the gills during stress. Rummer and her colleagues hypothesized that the red muscle capillaries of fish have high levels of carbonic anhydrase – an enzyme that produces carbon dioxide. As one of the fastest acting enzymes known, it could quickly acidify the blood, which would undermine the action of the acid pump, as carbon dioxide readily diffuses into the red blood cells. As a consequence, the pH in the red blood cells would be lower when they entered the capillaries near the muscle and the Root haemoglobins would release more oxygen and therefore increase oxygen delivery to the muscle. Rummer and colleagues used the same experimental setup as before, but this time added a carbonic anhydrase inhibitor to the fish's blood. This time the oxygen in the muscle did not increase. This showed that carbonic anhydrase found in the capillaries of muscles was necessary for the enhanced oxygen delivery to that tissue.Rummer and colleagues have shown for the first time that Root haemoglobins help fish deliver oxygen to all tissues, not just the retina and the gas bladder. More importantly, Root haemoglobins are responsible for the extraordinary capacity of bony fish for oxygen delivery, allowing this vertebrate group to successfully conquer almost every body of water on the planet.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,084

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0250,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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