The single-strand DNA/RNA-binding protein, Purβ, regulates serum response factor (SRF)-mediated cardiac muscle gene expressionThis paper is one of a selection of papers published in this Special Issue, entitled The Cellular and Molecular Basis of Cardiovascular Dysfunction, Dhalla 70th Birthday Tribute.
Notice bibliographique
Résumé
Single-strand DNA-binding proteins, Puralpha and Purbeta, play a role in cell growth and differentiation by modulating both transcriptional and translational controls of gene expression. We have previously characterized binding of Puralpha and Purbeta proteins to a purine-rich negative regulatory (PNR) element of the rat cardiac alpha-myosin heavy chain (MHC) gene that controls cardiac muscle specificity. In this study we investigated the role of upstream sequences of the alpha-MHC promoter in Purbeta-mediated gene repression. In the transient transfection analysis overexpression of Purbeta revealed a negative regulatory effect on serum response factor (SRF)-dependent alpha-MHC and alpha-skeletal actin expression in muscle cell background. Contrary, in nonmuscle cells, Purbeta showed no repressive effect. The results obtained from gel-shift assays demonstrated a sequence specific competitive binding of Purbeta to the minus strand of the SRF-binding, CArG box sequences of different muscle genes, but not to the SRF-binding, SRE sequences of the c-fos gene. These element-specific associations of Purbeta with muscle CArG boxes may, in part, explain why muscle gene expression is downregulated in disease states in which Purbeta levels are elevated. This data also provide a mechanistic distinction between muscle CArG boxes and nonmuscle serum response element (SRE) sequences in terms of their affinity to bind to SRF and their ability to regulate cell-specific gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».