The <i>CYP2B2</i> phenobarbital response unit contains binding sites for hepatocyte nuclear factor 4, PBX–PREP1, the thyroid hormone receptor β and the liver X receptor
Notice bibliographique
Résumé
A 163 bp enhancer in the CYP2B2 5' flank confers PB (phenobarbital) inducibility and constitutes a PBRU (PB response unit). The PBRU contains several transcription factor binding sites, including NR1, NR2 and NR3, which are direct repeats separated by 4 bp of the nuclear receptor consensus half-site AGGTCA, as well as an ER (everted repeat) separated by 7 bp (ER-7). Constitutive androstane receptor (CAR)-RXR (retinoic X receptor) heterodimers are known to bind to NR1, NR2 and NR3. Electrophoretic mobility-shift analysis using nuclear extracts from livers of untreated or PB-treated rats revealed binding of several other proteins to different PBRU elements. Using supershift analysis and in vitro coupled transcription and translation, the proteins present in four retarded complexes were identified as TRbeta (thyroid hormone receptor beta), LXR (liver X receptor), HNF-4 (hepatocyte nuclear factor 4) and heterodimers of PBX-PREP1 (pre-B cell homoeobox-Pbx regulatory protein 1). LXR-RXR heterodimers bound to NR3 and TRbeta bound to NR3, NR1 and ER-7, whereas the PBX-PREP1 site is contained within NR2. The HNF-4 site overlaps with NR1. A mutation described previously, GRE1m1, which decreases PB responsiveness, increased the affinity of this site for HNF-4. The PBRU also contains a site for nuclear factor 1. The PBRU thus contains a plethora of transcription factor binding sites. The profiles of transcription factor binding to NR1 and NR3 were quite similar, although strikingly different from, and more complex than, that of NR2. This parallels the functional differences in conferring PB responsiveness between NR1 and NR3 on the one hand, and NR2 on the other.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».