MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2066015693 · doi:10.1186/1756-0500-7-504

The CCR5Δ32 allele is not a major predisposing factor for severe H1N1pdm09 infection

2014· article· en· W2066015693 sur OpenAlexaboutno aff
Manuela Sironi, Rachele Cagliani, Chiara Pontremoli, Marianna Rossi, Guglielmo Marco Migliorino, Mario Clerici, Andrea Gori

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversità degli Studi di Milano
Mots-clésAlleleMedicineRisk factorGeneticsBioinformaticsInternal medicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Host genetic factors are thought to modulated the severity of disease caused by infection with the 2009 H1N1 pandemic influenza virus (H1N1pdm09). The human CCR5 gene encodes a cytokine receptor important for cell-mediated immune response against H1N1pdm09. A 32-bp polymorphic deletion in the coding sequence of CCR5, the so-called CCR5Δ32 allele, segregates in populations of European ancestry with a frequency of 8-15%. A high proportion of CCR5Δ32 heterozygotes was reported in a sample of white Canadian critically-ill H1N1pdm09 infected subjects, suggesting an association with disease severity. METHODS: We recruited 29 H1N1pdm09 infected subjects from Southern Europe (mostly Italians) with a wide clinical spectrum of disease symptoms; the sample included 7 subjects who developed acute respiratory distress syndrome requiring extracorporeal membrane oxygenation. The CCR5Δ32 variant was genotyped in all subjects. RESULTS: The CCR5Δ32 allele was found in one single subject, who developed a very mild form and was not hospitalized. CONCLUSIONS: The CCR5Δ32 allele was not found to be associated with the risk of H1N1pdm09 infection or with a severe disease course.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,329
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,174
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Research NotesMême sujetChemokine receptors and signalingTravaux en français237 207