Banking of fresh‐frozen prostate tissue: methods, validation and use
Notice bibliographique
Résumé
The question of banking of fresh frozen human prostatic tissue is addressed by a group of authors who have compared its value with what they call “pseudobanked” tissue. They then validate their methodology by a number of methods, including expression of hepsin, which they found to be significantly higher in malignant than in benign tissue. The theme of prostate cancer is continued by an English group looking at recent trends in the use of radical prostatectomy in England, and they make a number of interesting comments about this. Again in relation to prostate cancer, a group from Boston assess the use of steroids after prostate brachytherapy to reduce the risk of acute urinary retention. Authors from McGill University, Montreal and Beth Israel in Boston, comment on the controversial areas of insulin‐like growth factor and prostatic intraepithelial neoplasia and their role in the genesis of prostate cancer. Other interesting areas such as testicular sparing surgery in testis cancer, and a comparison of hand‐assisted laparoscopic versus open radical nephrectomy, are also described in this section. OBJECTIVE To describe the establishment, methods, validation and use of a bank of fresh‐frozen human prostate tissue. MATERIALS AND METHODS On obtaining informed patient consent, protocols were followed for banking prostate tissue from any type of prostatectomy or cystoprostatectomy. A pseudobanking procedure was devised to determine the accuracy of assessing the histopathological status of the banked tissue. RNA was extracted, its quality assessed and used for quantitative real‐time reverse transcription‐polymerase chain reaction for the serine protease hepsin . RESULTS To date prostate tissue from 112 patients has been banked, with pseudobanking in 58. The histopathological assessment showed pseudobanked tissue matched adjacent unbanked tissue in 98% of cases for benign vs malignant diagnoses, and in 92% of carcinomas for the Gleason score. Hepsin expression was significantly higher in malignant than in benign tissues ( P < 0.0001). CONCLUSION We established a validated method for banking human fresh‐frozen prostate tissue and applied it successfully. Hepsin expression can be used to differentiate malignant and benign prostate tissue, and as an indicator of tissue heterogeneity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,046 | 0,024 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,004 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».