Investigating the Potential of Genes Preferentially Expressed in Oocyte to Induce Chromatin Remodeling in Somatic Cells
Notice bibliographique
Résumé
The oocyte capacity to rejuvenate a differentiated nucleus to restart the proper embryonic program has been highly conserved between vertebrate species. In view of the recent progress to induce pluripotency in somatic cells with stemness genes, we investigated the potential of oocyte genes to contribute to chromatin rearrangements in somatic cells. We selected conserved genes that are naturally expressed mainly in oocytes and that were susceptible to play a role in reprogramming during early embryogenesis. We induced their expression by transient transfection in HEK293 cells. We then assessed whether they had a global impact on epigenetic events such as histone core modifications, and also on transcription and expression of pluripotency-associated transcription factors. Nucleoplasmin 2 (NPM2), activation-induced cytidine deaminase (AICDA), and Geminin (GMNN) overexpression induced differences in histone core modifications (methylation and acetylation). AICDA and NPM2 also influenced RNA neosynthesis. NPM2, GMNN, and STELLA induced overexpression of well-known pluripotency transcription factors. Overall, AICDA, GMNN, NPM2, and STELLA influenced at least one of the aspects analyzed. Their potential could be useful in increasing the cell receptivity to pluripotency induction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».