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Enregistrement W2066169608 · doi:10.1002/ajmg.a.32139

A novel locus for idiopathic generalized epilepsy in French‐Canadian families maps to 10p11

2008· article· en· W2066169608 sur OpenAlexafffundabout
Peter Kinirons, Dominique J. Verlaan, Marie‐Pierre Dubé, Josée Poirier, Charles Deacon, Anne Lortie, Jean‐François Clément, Richard Desbiens, Lionel Carmant, Cécile Cieuta‐Walti, Michael Shevell, Guy A. Rouleau, Patrick Cossette

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchScottish Rite Charitable Foundation of Canada
Mots-clésGeneticsGenetic linkagePedigree chartLocus (genetics)HaplotypeCandidate geneGenotypingBiologyIdiopathic generalized epilepsyGenetic heterogeneityGene mappingEpilepsyGeneGenotypeChromosomePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Idiopathic generalized epilepsy (IGE) has evidence of a strong genetic etiology. We conducted genomewide linkage analysis for genes responsible for familial IGE in French-Canadian pedigrees. Twenty families segregating autosomal dominant epilepsy were collected. Four larger IGE families sufficiently powerful for independent linkage analysis were genome-scanned and follow-up fine mapping was performed over regions with LOD scores >3.0. The genotyping of 16 smaller families was carried out at significantly linked loci for supportive linkage analysis and haplotype comparisons. One of the four families provided a significant linkage result at marker D10S1426 on chromosome 10 (two-point LOD score = 3.05, theta = 0, multipoint LOD score = 3.18). Fine mapping revealed a segregating haplotype and key recombination breakpoints, suggesting a candidate gene interval of 6.5 Mb. Multipoint linkage analyses using the additional 16 families yielded a maximum LOD score under heterogeneity of 4.23 (alpha = 0.34) at this locus. Evaluation of recombination breakpoints in these families narrowed the candidate region to 1.7 Mb. Sequencing of the two known genes in this region, NRP1 and PARD3, was negative for mutation. Replication of linkage to this locus in other cohorts of IGE families is essential to characterize the underlying genetic mechanism for the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,269
Score d'incertitude au seuil0,541

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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