MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2066347127 · doi:10.1074/jbc.m111.271189

Special AT-rich Binding Protein-2 (SATB2) Differentially Affects Disease-causing p63 Mutant Proteins

2011· article· en· W2066347127 sur OpenAlexafffund
Jacky Chung, Ron Grant, David R. Kaplan, Meredith S. Irwin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEctodermal dysplasiaBiologyTransactivationCraniofacialGeneticsMutantGeneMutationCell biologyTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

p63, a p53 family member, is critical for proper skin and limb development and directly regulates gene expression in the ectoderm. Mice lacking p63 exhibit skin and craniofacial defects including cleft palate. In humans p63 mutations are associated with several distinct developmental syndromes. p63 sterile-α-motif domain, AEC (ankyloblepharon-ectodermal dysplasia-clefting)-associated mutations are associated with a high prevalence of orofacial clefting disorders, which are less common in EEC (ectrodactyly-ectodermal dysplasia-clefting) patients with DNA binding domain p63 mutations. However, the mechanisms by which these mutations differentially influence p63 function remain unclear, and interactions with other proteins implicated in craniofacial development have not been identified. Here, we show that AEC p63 mutations affect the ability of the p63 protein to interact with special AT-rich binding protein-2 (SATB2), which has recently also been implicated in the development of cleft palate. p63 and SATB2 are co-expressed early in development in the ectoderm of the first and second branchial arches, two essential sites where signaling is required for craniofacial patterning. SATB2 attenuates p63-mediated gene expression of perp (p53 apoptosis effector related to PMP-22), a critical downstream target gene during development, and specifically decreases p63 perp promoter binding. Interestingly, AEC but not EEC p63 mutations affect the ability of p63 to interact with SATB2 and the inhibitory effects of SATB2 on p63 transactivation of perp are most pronounced for AEC-associated p63 mutations. Our findings reveal a novel gain-of-function property of AEC-causing p63 mutations and identify SATB2 as the first p63 binding partner that differentially influences AEC and EEC p63 mutant proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCancer-related Molecular PathwaysTravaux en français237 207