MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2066419471 · doi:10.1101/sqb.2000.65.193

Three-dimensional Structure and Function of Replication Protein A

2000· review· en· W2066419471 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology · 2000
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReplication protein ADNA replicationDNADNA repairReplication factor CBiologyBase pairEukaryotic DNA replicationCell biologyMolecular biologyBiophysicsChemistryDNA-binding proteinGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Replication protein A (RPA), the most abundant single-stranded DNA (ssDNA)-binding protein in eukaryotes, participates in nearly every aspect of DNA maintenance and is necessary for cell viability. RPA wasoriginally identified as an indispensable component ofDNA replication of simian virus 40 (SV40) (Wobbe et al.1987; Fairman and Stillman 1988; Wold and Kelly 1988).Later, it was also found to be involved in DNA recombination, and in the nucleotide excision, base excision, andrecombinational pathways of DNA repair (Wold 1997;Iftode et al. 1999). Although it is clear that RPA is essential in all of these processes, its exact role is not totally understood. RPA has no enzymatic activity; it binds tightlyto ssDNA in a defined orientation and establishes proteinprotein contacts with components of the DNA replication, recombination, and repair machinery. Since ssDNAis a common intermediate in DNA replication, recombination, and repair, one possible function that can be attributed to RPA is to protect ssDNA from nucleolyticdegradation or other modifications. RPA may also have amore active role of reducing the conformational entropyof ssDNA. Applying a mechanical tension on an ssDNAtemplate significantly increases the rate of DNA polymerization by decreasing the entropy of DNA and, consequently, the energetic cost of the work done by thepolymerase (Wuite et al. 2000). The applied tension onssDNA may mimic the effect of RPA binding. The ability of RPA to simultaneously bind ssDNA and mediateinteractions with multiple proteins may be necessary forthe ordered assembly of DNA replication and repaircomplexes if for no other reason than to establish the correct orientation of the first proteins in the pathway withrespect to the 5′-3′ polarity of DNA (de Laat et al. 1998;Iftode and Borowiec 2000). In fact, recent data suggestthat RPA participates not only in the initiation, but also inthe subsequent steps of the ordered assembly of replication and repair proteins by means of a competition-basedmechanism where proteins trade places for binding to acommon site on RPA (Yuzhakov et al. 1999; Kowalczykowski 2000; Mer et al. 2000b)...

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,974
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle