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Enregistrement W2066447255 · doi:10.1042/bj20060012

Transmembrane segment 1 of human P-glycoprotein contributes to the drug-binding pocket

2006· article· en· W2066447255 sur OpenAlexafffund
Tip W. Loo, M. Claire Bartlett, David M. Clarke

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVerapamilP-glycoproteinChemistryATPaseATP-binding cassette transporterBinding siteBiochemistryDithiothreitolPharmacologyBiologyEnzymeTransporterCalciumMultiple drug resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

P-glycoprotein (P-gp; ABCB1) actively transports a broad range of structurally unrelated compounds out of the cell. An important step in the transport cycle is coupling of drug binding with ATP hydrolysis. Drug substrates such as verapamil bind in a common drug-binding pocket at the interface between the TM (transmembrane) domains of P-gp and stimulate ATPase activity. In the present study, we used cysteine-scanning mutagenesis and reaction with an MTS (methanethiosulphonate) thiol-reactive analogue of verapamil (MTS-verapamil) to test whether the first TM segment [TM1 (TM segment 1)] forms part of the drug-binding pocket. One mutant, L65C, showed elevated ATPase activity (10.7-fold higher than an untreated control) after removal of unchanged MTS-verapamil. The elevated ATPase activity was due to covalent attachment of MTS-verapamil to Cys65 because treatment with dithiothreitol returned the ATPase activity to basal levels. Verapamil covalently attached to Cys65 appears to occupy the drug-binding pocket because verapamil protected mutant L65C from modification by MTS-verapamil. The ATPase activity of the MTS-verapamil-modified mutant L65C could not be further stimulated with verapamil, calcein acetoxymethyl ester or demecolcine. The ATPase activity could be inhibited by cyclosporin A but not by trans-(E)-flupentixol. These results suggest that TM1 contributes to the drug-binding pocket.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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