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Enregistrement W2066460368 · doi:10.4161/viru.2.4.17044

New surprises from within the black box of fungal melanization

2011· letter· en· W2066460368 sur OpenAlexaboutno aff
Alexander Idnurm

Notice bibliographique

RevueVirulence · 2011
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMelaninCryptococcus neoformansFungusAppressoriumCryptococcosisMeningoencephalitisVirulencePathogenesisDiseaseMicrobiologyPathogenic fungusImmunologyGeneticsGeneBotanyPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Melanins represent a group of dark pigments made of polymerized phenolic and indole subunits and whose exact structures are undefined. Melanin plays a number of roles in the biology of fungi, including being essential for pathogenesis via several mechanisms. Plant pathogens use melanin to build rigid appressoria structures to penetrate plant cell walls while human pathogens use it to protect against host immune responses. Despite this requirement for pathogenesis in diverse organisms, we remain in the dark about many features of melanin. In this issue of Virulence, Eisenman et al. reveal some surprising new aspects about melanization in the human pathogenic fungus Cryptococcus neoformans. C. neoformans and C. gattii are pathogens found around the world, causing disease in both immunocompromised and healthy patients, as well as in diverse mammalian species that include domestic pets, livestock, marsupials and even porpoises. The predominance of fatal cases is in AIDS patients in sub-Saharan Africa. The sudden emergence of C. gattii on Vancouver Island and subsequent spread into mainland Canada and the United States during the last decade, causing disease in healthy people and their pets, further illustrates the complex health challenges posed globally by this pair of species. Cryptococcus is contracted by inhalation to initiate a pulmonary disease in susceptible individuals. The fungus spreads from the lungs throughout the body, with the unusual ability to cross the blood-brain barrier to cause fatal meningoencephalitis. C. neoformans requires phenolic substrates to produce melanin. Those substrates are most prevalent in the New surprises from within the black box of fungal melanization

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0040,007
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0040,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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