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Enregistrement W2066477086 · doi:10.1021/ja055898c

Bacillibactin-Mediated Iron Transport in <i>Bacillus </i><i>s</i><i>ubtilis</i>

2005· article· he· W2066477086 sur OpenAlexaff
Emily A. Dertz, Jide Xu, Alain Stintzi, Kenneth N. Raymond

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2005
Typearticle
Languehe
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésEnterobactinChemistrySiderophorePermeaseBacillus subtilisFerricCatecholFerrichromePotentiometric titrationChelationStereochemistryBiochemistryInorganic chemistryEscherichia coliBacteriaIonOrganic chemistryBacterial outer membrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hexadentate triscatecholamide bacillibactin delivers iron to Bacillus subtilis and is structurally similar to enterobactin, although in a more oblate conformation. B. subtilis uses two partially overlapping permeases (1 and 2) to acquire iron from its endogenous siderophores (bacillibactin and itoic acid). Enterobactin and bacillibactin have opposite metal chiralities, different affinity for ferric ion, and dissimilar iron transport behaviors. The solution thermodynamic stability of ferric bacillibactin has been investigated through potentiometric and spectrophotometric titrations. The addition of a glycine to the catechol chelating arms causes a destabilization of the ferric complex of bacillibactin compared to ferric enterobactin. B. subtilis appears to express a separate receptor for enterobactin (permease 3), although enterobactin can also be transported through the permease for bacillibactin (permease 2).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations139
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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