Comparative Proteomics Analyses Reveal a Potential Biomarker for the Detection of Vancomycin-Intermediate <i>Staphylococcus aureus</i> Strains
Notice bibliographique
Résumé
Vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus (VISA) strains tend to develop during glycopeptide treatment of infections caused by methicillin-resistant S. aureus (MRSA). Rapid and effective detection methods for VISA strains are lacking, and mechanisms of resistance are unclear. Here, global comparative proteomic approaches have been used to identify potential biomarkers of intermediate vancomycin resistance. With the use of high-resolution two-dimensional gels and iTRAQ mass tagging, numerous proteins were found to be differentially expressed between clinical MRSA and VISA isolates of the same multilocus sequence type. One of these, the predicted lytic transglycosylase SAV2095 (SceD-like protein), was selected for further study based on both its high level of induction in Mu50 and its predicted role in modeling the cell wall, which is the target of vancomycin. Relative SAV2095 mRNA expression levels were compared between 25 MRSA and VISA/heterogeneous VISA clinical isolates by real-time RT-PCR. The SAV2095 mRNA was significantly induced in all VISA isolates relative to all MRSA strains ( p < 0.001), and significant induction of SAV2095 was also seen for several potential heterogeneous VISA strains that appear vancomycin-sensitive by standard minimum inhibitory concentration-determining methods. Furthermore, strains selected in vitro for increasing levels of resistance from four unrelated clinical MRSA isolates displayed concomitant increases in levels of SAV2095 expression. Together, these results suggest that SAV2095 expression level could serve as a molecular diagnostic marker for the rapid detection of VISA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».