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Enregistrement W2066613381 · doi:10.1186/1471-2431-10-82

The first three years of screening for medium chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency (MCADD) by newborn screening ontario

2010· article· en· W2066613381 sur OpenAlexafffundabout
Shelley Kennedy, Beth K. Potter, Kumanan Wilson, Lawrence Fisher, Michael T. Geraghty, Jennifer Milburn, Pranesh Chakraborty

Notice bibliographique

RevueBMC Pediatrics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversity of OttawaNewborn Screening OntarioOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesCanada Research ChairsLondon Health Sciences CentreHospital for Sick ChildrenHamilton Health Sciences
Mots-clésNewborn screeningMedicinePediatricsCompound heterozygosityInternal medicineChemistryMutationBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Medium chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency (MCADD) is a disorder of mitochondrial fatty acid oxidation and is one of the most common inborn errors of metabolism. Identification of MCADD via newborn screening permits the introduction of interventions that can significantly reduce associated morbidity and mortality. This study reports on the first three years of newborn screening for MCADD in Ontario, Canada. METHODS: Newborn Screening Ontario began screening for MCADD in April 2006, by quantification of acylcarnitines (primarily octanoylcarnitine, C8) in dried blood spots using tandem mass spectrometry. Babies with positive screening results were referred to physicians at one of five regional Newborn Screening Treatment Centres, who were responsible for diagnostic evaluation and follow-up care. RESULTS: From April 2006 through March 2009, approximately 439 000 infants were screened for MCADD in Ontario. Seventy-four infants screened positive, with a median C8 level of 0.68 uM (range 0.33-30.41 uM). Thirty-one of the screen positive infants have been confirmed to have MCADD, while 36 have been confirmed to be unaffected. Screening C8 levels were higher among infants with MCADD (median 8.93 uM) compared to those with false positive results (median 0.47 uM). Molecular testing was available for 29 confirmed cases of MCADD, 15 of whom were homozygous for the common c.985A > G mutation. Infants homozygous for the common mutation tended to have higher C8 levels (median 12.13 uM) relative to compound heterozygotes for c.985A > G and a second detectable mutation (median 2.01 uM). Eight confirmed mutation carriers were identified among infants in the false positive group. The positive predictive value of a screen positive for MCADD was 46%. The estimated birth prevalence of MCADD in Ontario is approximately 1 in 14 000. CONCLUSIONS: The birth prevalence of MCADD and positive predictive value of the screening test were similar to those identified by other newborn screening programs internationally. We observed some evidence of correlation between genotype and biochemical phenotype (C8 levels), and between C8 screening levels and eventual diagnosis. Current research priorities include further examining the relationships among genotype, biochemical phenotype, and clinical phenotype, with the ultimate goal of improving clinical risk prediction in order to provide tailored disease management advice and genetic counselling to families.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,845
Score d'incertitude au seuil0,947

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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