Lack of Association Between the rs6920220 (G/A) Polymorphism of the 6q23 Region and Biopsy-proven Giant Cell Arteritis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Recently, 2 independent studies have identified an association between several single-nucleotide polymorphisms (SNP) located in the 6q23 chromosomal region and rheumatoid arthritis (RA). Like RA, giant cell arteritis (GCA) is also a complex polygenic disease in which more than 1 genetic locus is likely to contribute to disease susceptibility and clinical expression. We analyzed the involvement of the rs6920220 (G/A) polymorphism from the 6q23/TNFAIP3 gene region in susceptibility to GCA. METHODS: Two hundred twenty patients with biopsy-proven GCA and 490 matched controls were assessed. DNA from patients and controls was obtained from peripheral blood. Samples were geno-typed for the 6q23 region rs6920220 using a TaqMan allele discrimination assay and by polymerase chain reaction (PCR) amplification. After PCR, the genotype of each sample was attributed automatically by allelic-specific fluorescence using the ABI Prism 7900 sequence detection system. RESULTS: No significant differences in the genotype distribution between patients with GCA and controls for the rs6920220 (G/A) polymorphism were found. No significant differences were observed when patients with GCA were stratified according to the presence of specific clinical features of the disease such as polymyalgia rheumatica or severe ischemic manifestations or specific visual ischemic complications. CONCLUSION: Our results show no involvement of this 6q23/TNFAIP3 gene region SNP in the susceptibility to or clinical expression of GCA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».