Guidelines for assessment of bone microstructure in rodents using micro–computed tomography
Notice bibliographique
Résumé
Use of high-resolution micro-computed tomography (microCT) imaging to assess trabecular and cortical bone morphology has grown immensely. There are several commercially available microCT systems, each with different approaches to image acquisition, evaluation, and reporting of outcomes. This lack of consistency makes it difficult to interpret reported results and to compare findings across different studies. This article addresses this critical need for standardized terminology and consistent reporting of parameters related to image acquisition and analysis, and key outcome assessments, particularly with respect to ex vivo analysis of rodent specimens. Thus the guidelines herein provide recommendations regarding (1) standardized terminology and units, (2) information to be included in describing the methods for a given experiment, and (3) a minimal set of outcome variables that should be reported. Whereas the specific research objective will determine the experimental design, these guidelines are intended to ensure accurate and consistent reporting of microCT-derived bone morphometry and density measurements. In particular, the methods section for papers that present microCT-based outcomes must include details of the following scan aspects: (1) image acquisition, including the scanning medium, X-ray tube potential, and voxel size, as well as clear descriptions of the size and location of the volume of interest and the method used to delineate trabecular and cortical bone regions, and (2) image processing, including the algorithms used for image filtration and the approach used for image segmentation. Morphometric analyses should be based on 3D algorithms that do not rely on assumptions about the underlying structure whenever possible. When reporting microCT results, the minimal set of variables that should be used to describe trabecular bone morphometry includes bone volume fraction and trabecular number, thickness, and separation. The minimal set of variables that should be used to describe cortical bone morphometry includes total cross-sectional area, cortical bone area, cortical bone area fraction, and cortical thickness. Other variables also may be appropriate depending on the research question and technical quality of the scan. Standard nomenclature, outlined in this article, should be followed for reporting of results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,021 | 0,027 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,010 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,003 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,007 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,017 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».