Nested PCR detection of microscopic life-stages of laminarian macroalgae and comparison with adult forms along intertidal height gradients
Notice bibliographique
Résumé
Recruitment of kelp species (Laminariales) to rocky marine habitats relies on the prior establishment of microscopic life-stages (zoospores, gametophytes, gametes and microscopic sporophytes). Unlike macroscopic sporophyte stages of kelp, microscopic life-stages have proved difficult to detect and identify in their natural habitat. Using a species-specific PCR-based assay, we developed a method to detect putative microscopic life-stages of 2 northeast Pacific kelp species, Nereocystis luetkeana (Mertens) Postels et Ruprecht and Hedophyllum sessile (C. Agardh) Setchell, from rocky intertidal substrate samples. Species-specific primers were evaluated for specificity and sensitivity. Comparisons of nested and unnested PCR were performed for both species. Nested PCR was used to screen for target species present on rocks obtained along an intertidal height gradient (0.0 to 3.5 m Lowest Low Water [LLW]) from 2 sites at monthly intervals in summer 2005. Vertical distribution patterns of the putative microscopic life-stages and the macroscopic sporophyte form were compared at both sites. Putative microscopic life-stages of N. luetkeana were detected at both sites and displayed a widespread vertical distribution with no clear spatial or temporal relationship. In comparison, H. sessile putative microscopic life-stage distribution was much more spatially restricted, showing a similar distribution to the macroscopic sporophyte. This study demonstrates the sensitivity, specificity and validity of utilizing molecular techniques to describe the distribution of microscopic life-stages of certain kelp species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».