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Enregistrement W2066796615 · doi:10.2108/zs140014

Diverse Families of Antimicrobial Peptides Isolated from Skin Secretions of Three Species of East Asian Frogs,<i>Babina daunchina</i>,<i>Babina adenopleura</i>, and<i>Rana omeimontis</i>(Ranidae)

2014· article· en· W2066796615 sur OpenAlexaff
Yuhong Hu, Shiqi Xu, Yonghong Hu, Chao Guo, Hao Meng, Jing Li, Jingze Liu, Hui Wang

Notice bibliographique

RevueZOOLOGICAL SCIENCE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensEmergent BioSolutions (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAntimicrobial peptidesAntimicrobialBacteriaMicrobiologyPeptideGram-negative bacteriaComplementary DNAFrog SkinRanaSecretionEscherichia coliBiochemistryGeneAnatomyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Twenty-two novel cDNAs encoding 22 peptide precursors for 19 mature peptides including antimicrobial peptides (AMPs) were identified from East Asian frog species Babina daunchina, Babina adenopleura, and Rana omeimontis skin-derived cDNA libraries. Two atypical members of the brevinin-1 family AMPs, named brevinin-1AN1 (FLTGVLKLASKIPSVLCAVLKTC) and brevinin-1DN1(FLKGVINLASKIPSMLCAVLKTC), were purified from the skin secretions of B. adenopleura and B. daunchina, respectively. A member of the ranatuerin-2 family AMP named ranatuerin-2DN1 (GLFDSITQGLKDTAVKLLDKIKCKLSACPPA) was also purified from the skin secretion of B. daunchina. One AMP named japonicin-2OM1 (FIVPSIFLLKKAFCIALKKNC) was purified from the skin secretion of R. omeimontis. The antimicrobial tests showed that brevinin-1DN1, brevinin-1DN2, brevinin-1AN1, and japonicin-2OM1 possess higher antimicrobial activity against Gram-positive bacteria than Gram-negative bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,538
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,009
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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