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Enregistrement W2066867391 · doi:10.1194/jlr.m200359-jlr200

Cloning of monkey RALDH1 and characterization of retinoid metabolism in monkey kidney proximal tubule cells

2003· article· en· W2066867391 sur OpenAlexaff
Hélène Brodeur, Isabelle Gagnon, Sylvie Mader, Pangala V. Bhat

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetinoic acidRetinalBiologyTretinoinBiochemistryMolecular biologyRetinoidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

All-trans and 9-cis retinoic acids function as ligands for retinoic acid receptors (RARs and RXRs), which are ligand-dependent transcription factors and play important roles in development and cellular differentiation. Several retinal dehydrogenases are likely to contribute to the production of all-trans and 9-cis RAs in vivo, but their respective roles in different tissues are still poorly characterized. We have previously characterized and cloned from kidney tissues the rat retinal dehydrogenase type 1 (RALDH1), which oxidizes all-trans and 9-cis retinal with high efficiency but is inactive with 13-cis retinal. Here we have characterized the retinal-oxidizing activity in monkey JTC12 cells, which are derived from kidney proximal tubules. In vitro assay of cell lysates revealed the presence of a NAD+-dependent dehydrogenase that catalyzed the oxidation of all-trans, 9-cis, and 13-cis retinal. Northern blot analysis of JTC12 RNAs and cloning by reverse transcription-polymerase chain reaction demonstrated expression of a monkey homolog of RALDH1. Bacterially expressed JTC12 RALDH1 catalyzed conversion of all three retinal isomers, with a higher catalytic efficiency for 9-cis retinal than for all-trans and 13-cis retinal. Accordingly, live JTC12 produced 9-cis retinoic acid more efficiently than all-trans retinoic acid from their respective retinal precursors. Only metabolites corresponding to the same steric conformation were formed from 9-cis or all-trans retinal, indicating a lack of detectable isomerizing activity in JTC12 cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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