Transcriptome comparison of winter and spring wheat responding to low temperature
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Freezing tolerance in plants is a complex trait that occurs in many plant species during growth at low, nonfreezing temperatures, a process known as cold acclimation. This process is regulated by a multigenic system expressing broad variation in the degree of freezing tolerance among wheat cultivars. Microarray analysis is a powerful and rapid approach to gene discovery. In species such as wheat, for which large scale mutant screening and transgenic studies are not currently practical, genotype comparison by this methodology represents an essential approach to identifying key genes in the acquisition of freezing tolerance. A microarray was constructed with PCR amplified cDNA inserts from 1184 wheat expressed sequence tags (ESTs) that represent 947 genes. Gene expression during cold acclimation was compared in 2 cultivars with marked differences in freezing tolerance. Transcript levels of more than 300 genes were altered by cold. Among these, 65 genes were regulated differently between the 2 cultivars for at least 1 time point. These include genes that encode potential regulatory proteins and proteins that act in plant metabolism, including protein kinases, putative transcription factors, Ca2+ binding proteins, a Golgi localized protein, an inorganic pyrophosphatase, a cell wall associated hydrolase, and proteins involved in photosynthesis.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle