Glycosaminoglycan Binding Properties of the Myxoma Virus CC-chemokine Inhibitor, M-T1
Notice bibliographique
Résumé
Poxviruses encode a number of secreted virulence factors that function to mitigate or modulate the host immune response. M-T1 is a secreted 43-kDa glycoprotein produced by the myxoma virus, a poxvirus pathogen of rabbits, that binds CC-chemokines with high affinity, blocks binding to their cognate G-protein coupled receptors, and thereby inhibits chemokine-induced leukocyte chemotaxis. The present study indicates that M-T1, but not the related vaccinia virus 35-kDa CC-chemokine-binding protein, can localize to cell surfaces through an interaction with glycosaminoglycan molecules. In addition to biochemically characterizing the nature of this interaction, we demonstrate that M-T1 can also simultaneously interact with CC-chemokines while bound to heparin, suggesting that the binding sites on M-T1 for chemokines and heparin are distinct. Furthermore, using recombinant baculovirus-expressed M-T1 truncation and internal deletion mutants, we localize the heparin-binding region of M-T1 to the C terminus of the protein, a region that contains a high abundance of basic residues and includes two clusters of basic amino acid residues that resemble Cardin and Weintraub heparin-binding consensus sequences. The ability of M-T1 to simultaneously interact with chemokines and glycosaminoglycans may enable M-T1 to tether to endothelial surfaces or extracellular matrix and capture host chemokines that are expressed close to sites of virus infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».