Baboon Lipoprotein(a) Binds Very Weakly to Lysine−Agarose and Fibrin Despite the Presence of a Strong Lysine-Binding Site in Apolipoprotein(a) Kringle IV Type 10
Notice bibliographique
Résumé
Human apolipoprotein(a) kringle IV type 10 [apo(a) KIV(10)] contains a strong lysine-binding site (LBS) that mediates the interaction of Lp(a) with biological substrates such as fibrin. Mutations in the KIV(10) LBS have been reported in both the rhesus monkey and chimpanzee, and have been proposed to explain the lack of ability of the corresponding Lp(a) species to bind to lysine and fibrin. To further the comparative analyses with other primate species, we sequenced a segment of baboon liver apo(a) cDNA spanning KIV(9) through the protease domain. Like rhesus monkey apo(a), baboon apo(a) lacks a kringle V (KV)-like domain. Interestingly, we found that the baboon apo(a) KIV(10) sequence contains all of the canonical LBS residues. We sequenced the apo(a) KIV(10) sequence from an additional 10 unrelated baboons; 17 of 20 alleles encoded Trp at position 70, whereas only two alleles encoded Arg at this position and thus a defective LBS. Despite the apparent presence of a functional KIV(10) LBS in most of the baboons, none of the Lp(a) in the plasma of the corresponding baboons bound specifically to lysine-Sepharose (agarose) even upon partial purification. Moreover, baboon Lp(a) bound very poorly to plasmin-modified fibrinogen. Expression of baboon and human KIV(10) in bacteria allowed us to verify that these domains bind comparably to lysine and lysine analogues. We conclude that presentation of KIV(10) in the context of apo(a) lacking KV may interfere with the ability of KIV(10) to bind to substrates such as fibrin; this paradigm may also be present in other non-human primates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».