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Lack of linkage disequilibrium between serotonin transporter protein gene (SLC6A4) and bipolar disorder

2000· article· en· W2067112083 sur OpenAlexaff
Emanuela Mundo, Melissa Walker, H. Tims, Fabìo Macciardi, James L. Kennedy

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransmission disequilibrium testSerotonin transporterLinkage disequilibriumBipolar disorderGeneticsProbandPsychologyPsychiatryBiologyAlleleHaplotypeGenotypeGeneLithium (medication)Mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The serotonin transporter (5HTT) gene appears to be of particular interest as 5HTT is the selective site of action of selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs) that successfully treat bipolar depression (BP). The 5HTT gene is located on chromosome 17q11.1-q12 and has a 44 bp deletion/insertion functional polymorphism in the promoter region (SLC6A4). Results from association studies on SLC6A4 and BP disorder are conflicting. The aim of the present study was to investigate for the presence of linkage disequilibrium between SLC6A4 and BP disorder. One hundred thirty-three Bipolar I or Bipolar II probands with their living parents were recruited. Diagnoses were assessed by the structured interview for the Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, fourth edition [DSM-IV, American Psychiatric Association, 1994] (SCID-I). Genotyping was performed with standard procedures and data were analyzed using the Transmission Disequilibrium Test [TDT, Spielman et al., 1993: Am J Hum Genet 52: 506-516]. One hundred two triads were informative for the analysis. Each of the two alleles of the SLC6A4 was transmitted at the same rate to bipolar probands (chi(2) = 0.692, df = 1, P = NS). Thus, it appears unlikely that the SLC6A4 plays a fundamental role in the pathogenesis of BP disorder. However, further studies focusing on the role of the 5HTT gene in predicting the response to SSRIs in BP patients might be worthwhile.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,515
Score d'incertitude au seuil0,757

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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