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Enregistrement W2067127991 · doi:10.1139/o04-003

Multiple variants and a differential splicing pattern of kinectin in human hepatocellular carcinoma

2004· article· en· W2067127991 sur OpenAlexvenueno aff
Hongcheng Wang, Yan-Rong Su, Ke-Jun Han, Xuewen Pang, Jirun Peng, Bin Liang, Shan Wang, Weifeng Chen

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHepatocellular carcinomaRNA splicingImmunogenicityAlternative splicingcDNA libraryComplementary DNARecombinant DNAAntigenMolecular biologyGeneImmunologyGeneticsMessenger RNARNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To extend the search for hepatocellular carcinoma (HCC) associated antigens with immunogenicity for clinical applications, we constructed a cDNA expression library using resected human HCC tissue sample and screened it by serological analysis of recombinant cDNA expression library (SEREX) with autologous and allogeneic sera. A total of 24 distinct antigens were isolated and kinectin was the antigen most frequently identified. We found that kinectin was alternatively spliced at four sites and obtained all eight theoretical forms of variant, six by SEREX and two by RT-PCR, from the different splicing combinations of the last three sites. In addition, the splicing patterns of four sites were analyzed. Variant containing D2 was overexpressed in cancerous tissues and this alteration may be tumor associated. The four splicing sites, the variants generated by alternative splicing, and the humoral immune response in HCC patients, may help to analyze the role of kinectin in human HCC cell biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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