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Enregistrement W2067132609 · doi:10.1021/jp0344390

Inner-Shell Excitation Spectroscopy of the Peptide Bond:  Comparison of the C 1s, N 1s, and O 1s Spectra of Glycine, Glycyl-Glycine, and Glycyl-Glycyl-Glycine

2003· article· en· W2067132609 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensMcMaster UniversityCanadian Light Source (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro
Mots-clésChemistrySpectral lineExcited stateCrystallographyGlycineSpectroscopyAnalytical Chemistry (journal)Atomic physicsAmino acidPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oscillator strengths for C 1s, N 1s, and O 1s excitation spectra of gaseous glycine and the dipeptide, glycyl−glycine, have been derived from inner-shell electron energy-loss spectroscopy recorded under scattering conditions where electric dipole transitions dominate (2.5 keV residual energy, θ ≈ 2°). X-ray absorption spectra of solid glycine, glycyl−glycine, glycyl−glycyl−glycine, and a large protein, fibrinogen, were recorded in a scanning transmission X-ray microscope. The experimental spectra are assigned through interspecies comparisons and by comparison to ab initio computed spectra of various conformations of glycine and glycyl−glycine. Inner-shell excitation spectral features characteristic of the peptide bond are readily identified by comparison of the spectra of gas-phase glycine and glycyl−glycine. They include a clear broadening and a ∼0.3 eV shift of the C 1s → π* C O peak and introduction of a new pre-edge feature in the N 1s spectrum. These effects are due to 1s → π* amide transitions introduced with formation of the peptide bond. Similar changes occur in the spectra of the solids. The computational results support the interpretation of the experimental inner-shell spectra and provide insight into electron density distributions in the core excited states. Possible conformational dependence of the inner-shell excitation spectra was explored by computing the spectra of neutral glycine in its four most common conformations, and of glycyl−glycine in planar and two twisted conformations. A strong dependence of the computed C 1s, N 1s, and O 1s spectra of glycyl−glycine on the conformation about the amide linkage was confirmed by additional ab initio calculations of the conformational dependence of the spectra of formamide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,919

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle